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所在的這一艘孤零零的船隻宛如一片脆弱的樹葉，隨著上下瘋狂蕩漾的水面左右搖擺不定。船身發出嘎吱嘎吱的響聲，彷彿隨時都會散架一般，在船上的人員緊緊抓住身邊一切可以固定身體的東西，試圖穩住自己的身形，但在如此劇烈的搖晃下，他們的努力顯得微不足道。
“天氣怎麼又反覆無常的變化了？”小智整個人都快摔倒在地上了。
白夜趕忙伸手將小智給拉了上來，“不清楚，但很清楚的一件事是這絕對不是橘子群島的正常變化。”
不僅僅是橘子群島這樣子，全球各地都發生了極端的天氣變化，雷電，冰雹，暴風雪，高溫……整個世界似乎都陷入了混亂之中。
與此同時的大木博士研究所，大木博士和花子阿姨也看到了全球各地都陷入極端天氣的新聞，就連研究所的玻璃都承受不住暴風雪的侵蝕破碎了。
當新聞指出發源地是橘子群島的時候兩人頓時想到小智白夜他們，因為他們現在正好就在橘子群島旅行。
就在這時有一通電話打了過來，大木博士接通之後發現是橘子群島的內木博士，內木博士表明現在整個橘子群島的神奇寶貝們都發生了變化。
…………
當小智白夜所在船靠近島嶼的時候水面變得更加的瘋狂搖晃，不僅如此靠近海面的礁石也大量地伸了出來，為此小美不得不費盡大量的心思控制船隻應對這些突如其來的襲擊，只可惜在最後船也失去了控制隨後被海浪推到了岸邊，伴隨著一陣劇烈的搖晃他們總算是有驚無險的到達了島嶼上。
“仙子伊布\/皮卡丘你沒事吧？”
“xianzi！\/pika！”
就在這時皮卡丘好像感應到了什麼瘋狂跳下船隨後朝著天然的石階梯上跑去，另一邊的仙子伊布擔心皮卡丘也趕忙跟了上去。
“等一下！現在太危險了你們先不要走！”
“但是仙子伊布和皮卡丘是我們最重要的夥伴啊！小美船長你先留在這，我和小夜去找皮卡丘和仙子伊布！”
