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許多將領也紛紛獻計獻策，試圖打破僵局。斯普魯恩斯主張直搗硫黃島和沖繩島：福雷斯特爾、謝爾曼主張根本放棄臺灣，12月進軍呂宋，1945年初進攻小笠原群島和琉球群島。
謝爾曼的方案得到尼米茲、斯普魯恩斯以及陸軍第10集團軍司令巴克納將軍、中太平洋航空兵司令哈蒙將軍的支援。在9月29日一10月1日，金上將在舊金山召集的非正式會議上放棄了自己的主張，同意打硫黃島和沖繩島，而不打臺灣，並表示將向參謀長聯席會議提出建議。
10月3日，美參謀長聯席會議對麥克阿瑟和尼米茲頒發了這次戰爭中最後一個重要的戰略指令：麥克阿瑟於1944年12月20日進攻呂宋島，尼米茲負責掩護和支援。尼米茲於1945年1月20日進攻小笠原群島、硫黃列島中的一個或數個島嶼（如流黃島），於3月1日進攻琉球群島中的一個或數個島嶼（如沖繩島）。
在雷伊泰灣戰役即將開始之際，哈爾西不遺餘力地實施了大規模的空中轟炸。他的初步任務是切斷日本和菲律賓之間的交通線，儘可能多地消滅敵機。尼米茲透過哈爾西的報告，知道第38特混艦隊10月10日襲擊了沖繩島，11日掃射了呂宋機場，從12日起連續3天向臺灣發動了攻擊，襲擊運輸艦隻、機場和島上設施，擊落了大批敵機，其中不少是艦載機。
空戰和空襲結果，日本損失飛機600餘架，損失艦船26艘。一而哈爾西僅僅損失89架飛機，另有2艘巡洋艦&ot;坎培拉&ot;號和&ot;休斯頓&ot;號被日機魚雷擊中，失去了自航能力。哈爾西指示一個特混大隊將受傷艦隻拖回烏裡錫島。
不料第二天，東京廣播電臺宣佈了一條驚人訊息：&ot;我部隊自10月12日以後，連夜猛攻臺灣及呂宋東部海面的敵機動部隊，擊潰其過半兵力，迫使其潰退。&ot;廣播電臺還報導日本各城市慶祝勝利的情況。為了抵消日軍的宣傳，尼米茲發表了一個新聞公報：&ot;尼米茲將軍欣悉，最近東京廣播電臺所謂第3艦隊被擊潰的艦隻已被哈爾西營救出來，正在收回準備迎戰敵人。&ot;
就在日本國民還陶醉在&ot;勝利&ot;的彌天大謊之中時，麥克阿瑟率18萬之眾，在金凱德第7艦隊的738艘艦隻的運送與直接掩護下，在哈爾西第3艦隊的16艘航空母艦、6艘戰列艦以及73艘輕重巡洋艦和驅逐艦的支援下，直趨雷伊泰灣。10月20日凌晨，美軍在雷伊泰灣大舉登陸。
10月20日下午，麥克阿瑟將軍在菲律賓總統奧斯梅納陪同下，涉水上岸。他在驟雨中手持麥克風，向菲律賓國民演講。演講透過大功率電臺反覆播出：
這裡是自由之聲廣播電臺，麥克阿瑟將軍在講話。菲律賓的朋友們：我回來了！託上帝的福，我們的軍隊又站在菲律賓這塊灑滿我們兩國人民鮮血的土地上了。……團結在我的周圍吧。讓我們在巴丹和科雷希多不屈不撓的戰鬥精神的鼓舞下繼續前進。站起來戰鬥吧！抓住一切有利時機進行戰鬥。
為了你們的家園和子孫後代戰鬥吧！
尼米茲聽到這一訊息，心情複雜。他為收復失地而高興，但不得不接受偶爾聽到的水兵們說得一句話：&ot;感謝上帝，也感謝陸戰隊，麥克阿瑟收復了菲律賓。&ot;麥克阿瑟又一次大出風頭，而海軍和陸戰隊雖在戰鬥中浴血奮戰卻默默無聞。
好在羅斯福總統沒有忘記為這次進攻戰鋪平道路和把進攻部隊送往島上的海軍艦艇，他在給麥克阿瑟發去賀電的同時，也給尼米茲和哈爾西發來熱情的祝捷電報：
全國為你們的艦隊在敵人海域內取得的輝煌勝利感到自豪。我們對你們航空兵的英勇善戰和水兵的吃苦耐勞精神十分欽佩。你
