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，碇真嗣都會狠狠的打一個冷顫，對於他來說，那份記憶無比的沉重，唯一能夠令他稍微心安的是，最後他並沒有殺了明日香。
即時明日香後來還是死了……
而此時，這個曾經不顧自己的哀求決然的開啟了傀儡系統的父親又再次啟動了這個系統，他到底要幹什麼？！
“你到底要做什麼！”碇真嗣憤怒的大聲喊著，他的身體在微微的顫抖，即便是到了現在他仍然不敢真正的去面對自己那冷漠的父親，只能躲在這駕駛艙中，無力的發洩。
“建造eva的初衷，對外公佈是為了擊敗使徒拯救人類，一直以來，你們都是這麼認為的吧。”碇源渡的聲音響起，憤怒中的碇真嗣卻沒有注意到，這個冷漠的父親此時的語氣，少了幾分冰冷。
“人類的科技發展確實充滿了無限的可能，但是使徒這種近乎於神的生命體，真的是人類可以複製的嗎？從這方面來說，民眾們都太過於高估那些科學家們的智慧了。”
“父親，你在，說什麼？”安靜下來的碇真嗣終於發現了碇源渡的異樣，他的聲音漸漸變得輕柔，彷彿一個認真的為自己的孩子講故事的……父親一般。
“在第二次衝擊之後，seele組織與奄奄一息的第二使徒莉莉絲做了一個交易：由莉莉絲交給人類創造eva的技術，而人類，則要為莉莉絲，創造一個新的可容納的身軀，一個更加強大的身軀！”
“就這樣，eva相繼問世了，而莉莉絲也找到了一個合適的，強大的身軀，那便是初號機！”碇源渡的身體突然轉冷，碇真嗣分明可以聽到這聲音之中的……憎恨！
碇真嗣渾身一顫，初號機？
“但是初號機的最初啟用需要一個純淨的靈魂作為引子，而最終，我的妻子，你的母親，碇唯，成為了這個引子的奉獻者！”碇源渡的聲音冰冷如喜馬拉雅山巔的寒風，話語中透出的憤怒與悔恨，令碇真嗣心驚。
“最終教條中存放的莉莉絲靈魂不過是一個吸引使徒視線的幌子，而真正的莉莉絲，早就已經將大半的靈魂封進了初號機之中！”
“只是在佔據初號機的過程中，莉莉絲低估了唯的力量，本就苟延殘喘的她在初號機中敗給了唯，最終只能將這大半進入初號機之中的靈魂封印，而剩餘的靈魂，一小部分用來創造麗，其餘的則不知在何處潛伏了起來。”
“綾波？”碇真嗣失神的呢喃著，他被碇源渡所說的這超乎尋常的內容給震驚了，甚至他此刻才知道，原來自己的母親，一直都陪在自己的身邊？
重傷之後那種被保護的感覺，原來是母親嗎？
“碇源渡，看起來，你並不打算履行我們當初的約定。”清冷空靈的女聲響起，碇真嗣一個激靈，是誰？
“莉莉絲，你終於現身了。”昏暗的巨大地下室中，殘破的初號機橫躺在地上，碇源渡就站在初號機的頭部旁，他的身邊是一直沉默著的冬月耕造。此時，碇源渡摘下了一直以來從未摘下過的墨鏡，那雙普通的雙眼中，燃燒著仇恨的怒火。
地下室頂部一個白色的虛幻的女性身軀浮現，令人看不太真切，但卻感覺得到她確實的存在。
“碇源渡，我幫助你完成了c計劃，做為報酬，你將幫助我奪取初號機的完全控制權……現在，你要反悔嗎？”莉莉絲朝碇源渡問道，白色的靈魂體溢散著點點的光芒。
“不，我不會反悔，因為在將你毀滅之後，便無所謂反悔還是履約了。”碇源渡嘴角微微翹起，臉上的神情，是決絕，亦是諷刺！
“碇源渡，你承受不起，反悔的代價。”莉莉絲的聲音出現了一絲波動，像是在諷刺碇源渡的自以為是。
“我承受得起，因為我很清楚，你在c計劃的程序中所做的手腳。”碇源渡重新帶上墨鏡
