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為了加強北京的地位，朱棣主要採取了兩方面的措施。一方面，他大規模地向北京移民屯田，加強它的經濟力量，穩定它的秩序，另一方面，徵調軍隊佈置在它的周圍，以加強保衛它的軍事力量。
先說第一方面，移民屯田：
洪武三十五年(建文四年)九月乙未，命戶部遣官核實山西太原、平陽二府，澤、潞、遼、沁、汾五州丁多田少及無田之家，分其丁口以實北平。各府州縣仍戶給鈔，使置牛具種子，五年後徵其稅。
永樂元年，令選浙江、江西、湖廣、福建、四川、廣東、廣西、陝西、河南及直隸蘇、松、常、鎮、揚州、淮安、廬州、太平、寧國、安慶、徽州等府無田糧並有田糧不及五石殷實大戶充北京富戶，附順天府籍，優免差役五年。
永樂二年九月丁卯，徙山西太原、平陽、澤、潞、遼、沁、汾民一萬戶實北京。
永樂三年九月丁巳，徙山西太原、平陽、澤、潞、遼、沁、汾民一萬戶實北京。
其時，也有一些人戶自願赴北京種田：
永樂四年正月已未，湖廣、山西、山東等郡縣吏李懋等二百十四人言，願為民北京。命給道里費遣之。
還有一些軍士被放歸鄉裡種田：
洪武三十五年(建文四年)十二月壬申，戶部尚書掌北平布政司事郭資奏：北京、保定、永平三府之民，初以垛集充軍從徵，有功者已在爵賞中矣。其力弱守城者，病亡相繼，輒取戶丁補役，故人民衰耗甚至戶絕，田土荒蕪。今宜令在伍者籍記其名，放還耕種，俟有警急，仍復徵用……從之。
或者收流民以復業：
永樂元年正月庚辰，北平布政司奏，諸郡流民復業者凡十三萬六百餘戶。上命戶部令有司加意綏撫，勿重擾之。
永樂元年十一月戊寅，書諭世子曰：山後官員軍民，本皆無罪之人，曩因建文殘害骨肉，禍及無辜，不得已逃遁，飄零艱窘，深可哀矜。今既來歸，其令官仍原職，兵仍原伍，民仍原業，鹹加綏撫。後有歸者悉如之。
或者釋罪囚以種田：
洪武三十五年(建文四年)九月乙巳，命武康伯徐理等往北平度地，以處民之以罪徙者。
永樂元年六月庚戌，戶部致仕尚書王鈍言三事。一，種田囚人……宜不分籍貫，於保定、真定、順天等府所屬州縣挨程安置，先近後遠，庶幾聚落易成，屯種有效。
永樂元年八月己巳，定罪囚北京為民種田例。先是，刑部鄭賜、都察院左都御史陳瑛等上言……北京永平、遵化等處，壤地肥沃，人民稀少，今後有犯者，令於彼耕戍，涉歷辛苦，頓挫奸頑，庶幾良善獲安，詞訟簡息。凡徒流罪除樂王、灶匠拘役，老幼殘疾收贖，其餘有犯俱免杖，編成裡甲，並妻子發北京永平等府州縣，為民種田。定立年限，納糧當差……上是之。
永樂元年十一月戊戌，諭世子曰：朕念北京兵變以來，人民流亡，田地荒蕪，故法司所論有罪之人，曲垂寬宥，悉發北京境內屯種。意望數年之後，可以助給邊儲，省饋運之勞，且使有罪者亦得保全。
當時，朱棣殘酷鎮壓政治反對派，以嚴刑苛法臨天下，所在囚徒累累，此問題之又一面也。為了保證屯種的進展，官府給予牛具種子：
洪武三十五年(建文四年)八月甲寅，上以北平、山東、河南累年經兵，民缺耕牛，特命王部於直隸鳳陽、淮安等處以官牛給之。
永樂元年十二月戊寅，工部尚書黃福奏，陝西行都司所屬屯田，多缺耕牛耕具，合準北京例，官市牛給之，耕具於陝西布政司所屬鑄造。
永樂二年三月丙寅，撫按江西給事中朱肇言：比者工部遣人於江西買牛，令有司遞送淮安轉運北平給軍屯種，未免勞民。今江西、浙江、湖廣所屬郡縣積歲沒
