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某一天，一支特種部隊侵入這家研究院。這裡被炸燬，神諭細胞也隨風飄散到空氣當中。之後不久，世界各地都出現了許多兇猛的野獸。它們成群出現，襲擊人類，還可以自主進化。
起初，人們不以為意，各國還是互相打仗，直到事態再也無法控制，人們才意識到，放任這些由神諭細胞構成的生物進化下去，有多麼可怕。人類，很可能會被些生物給滅絕。面對這種威脅，各國終於聯合了起來。他們共同研究強大的武器，用來對付這些危險怪物。
可是，有些錯誤一旦犯下，就無法挽回了。這些生物，表面看上去殺死了，可是他們的身體細胞仍有活性。有活性的神諭細胞會自動脫離主體，重新組成新的個體，甚至發生進化。
人們意識到，這些東西殺不死，也殺不完。人們面對這些生物的侵襲，只能維持相對平衡的狀態。
克雷斯星球上的人，平均壽命很低，只有不到幾十年。為了對付神諭生物，研究人員將神諭細胞和人體結合，從而提升力量來使用他們研究的弒神武器。結果，好多參加戰鬥的青年，未成年就死了。有戰死的，也有被自己體內的神諭細胞吞噬的。雙方的平衡，漸漸向神諭生物傾斜。
為了解決培養的戰士跟不上戰鬥消耗的問題，一個叫卡爾薩斯的人研究出了一個可以進行神經連結的超級計算機主機——玄冥。人們的意識可以透過神經連結進入玄冥，到時候，意識可以再利用玄冥控制身體。玄冥還可以將人的意識以資料的形式儲存起來，這樣一來，只要玄冥存在，人的意識就不會消失。只要將人的身體改造成半機械狀態用來儲存意識，戰士就可以重生。
玄冥科技誕生後，戰場上，半機械戰士就代替融合了神諭細胞的戰士，人類從此穩住了局面。
卡爾薩斯本以為，從此克雷斯可以進入半機械文明時代，可是各國領導卻覺得，那些半機械戰士太過危險，結果卡爾薩斯的研究，就遭到了各國的反對。卡爾薩斯由於不甘心，便領導著跟隨他的一小部分人，發起了一場機械戰爭。
當時的一千多年以前，天神星域天神文明內戰結束，冥王被放逐到宇宙當中。幾百年後，冥王漂流到天河系，發現了天使文明。冥王一開始想要統治這裡，可是天使戰士太多，冥王最終失敗。
冥王在發現了天使的強大後，便用詭計，騙天使女王希德·妮亞帶宇宙艦隊征討天神星域。結果，宇宙史上兩個相距三十多萬光年，除了發源地一樣，其他毫不相關的文明，就這樣開戰了。宇宙史稱，第一次宇宙神戰。
不過，第一次神戰並不是很激烈，因為天神文明無心開戰。只是，由於冥王從中作梗，導致雙方糾纏了兩年。好在最後，希德妮亞和當時的神王玉曦，識破了冥王的陰謀，第一次神戰就此終止。
之後，雙方化解了仇怨，決定一起審判冥王，可惜冥王趁機逃走，後加入惡魔艦隊。
後來，天使利用蟲洞，在天河與神河兩個星河之間建立起了宇宙空間傳送通道。從此，兩個文明之間可以互相往來。
從那以後，神王玉曦和希德妮亞，分別將王位傳給了龍羲和愛爾蘭·希德·問雅。至於他們兩位，則踏上了探索其它星河的宇宙征程。
當時，玉曦帶上了上萬天兵神將，五百太空戰舟，希德妮亞女王也帶了上千天使，以及上百艘天使戰艦。雙方一起探索其它星河，在近千年時間裡，發現了不少智慧文明。
在希德妮亞女王和玉羲神王一起探索其它星河的時候，天河系的天使艦隊也在擴建傳送蟲門，探索其它恆星系。在此期間，天使偶然發現了克雷斯星球，當時克雷斯星球上正處於戰爭時期。那正是卡爾薩斯發起的機械戰爭。為了幫助他們，天使決定入駐這顆星球。
在天使的幫助下，卡爾薩
