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不希望在激烈戰鬥的時候身邊的自己人突然變成敵人……我將你們拉到這艘船上的理由也是一樣的！”
亞瑟的話頓時說的陳杰啞口無言，不過想想的確如此，如果激烈的戰鬥中身邊的友軍突然變成了敵人，那是多麼的可怕？
“時間有限，我們分成3隊行動，”亞瑟發號施令道：“奧利維拉和紫芸的機器僕人Freedom一隊，陳杰和藍瑪麗一隊，我和柴飛一隊，算算時間剩下人也差不多已經全部覺醒併到了紐約市，我們必須迅速找出他們並將他們全部救出來，然後將主人公尼奧救出來。紫芸，將飛船上升到安全的廣播位置。”
“尼布甲尼撒號請求的會面聯絡呢？”紫芸平靜的看著亞瑟問道。
“不用管他，如果有時間的話我會去會會他的。”亞瑟嘴角露出一抹笑意：“所有人務必要小心，遇見特工最好立刻逃跑，作為Matrix的守衛，他們的實力絕對不容小視！”
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此時主人公尼奧，或者說他的本名托馬斯？安德森最近有點鬱悶。
他一直有一種奇怪的感覺，自己生活的世界並不是那麼的真實，有時候甚至無法分清夢境與現實，不過那也只是自己的臆想罷了，或許自己是睡眠不足。
不過接下來的幾天尼奧的生活發生了翻天覆地的變化，3名穿著西服帶著墨鏡的男子找到了他，據說是維護國家安全的特工。
尼奧不知道為什麼特工這種身份特殊的人會找上自己，不過是出名網路駭客的他倒是有少許的心虛，畢竟自己幾乎將駭客所有能犯的罪都犯了一遍。
但是性格倔強的尼奧卻不打算承認，他在被特工帶去警局審問的時候就做好了抗拒的準備，美國的司法系統究竟如何大家心知肚明。
之後發生的事情卻讓尼奧無比驚訝。
如同原劇中出現的一幕，在審問中抗拒不配合的尼奧的嘴巴竟然慢慢的合攏消失，尼奧說不出一句話，接著他被兩名特工摁住，而那名叫史密斯的特工將一條噁心的蟲子從他的肚臍部位塞了進去。
當他猛然睜開眼睛時，卻發現自己躺在自己家的床上，似乎什麼事都沒有發生。
“我這是怎麼了？”從床上坐起來的尼奧疑惑的思索道，他現在越發分不清什麼是真實什麼是夢境了。
而在尼奧家的樓下，史密斯帶著兩名特工就站在街角附近。
“那些自我覺醒的特殊人類為什麼紛紛來到紐約打聽尋找這個叫托馬斯？安德森的人？”史密斯看著尼奧家的視窗平靜的問道。
“不清楚，他們的舉止非常怪異。”第一名特工平靜的說道。
“或許我們應該抓一個自我覺醒的人類來審問。”第二名特工開口道。
“之前覺醒的特殊人類跑到哪裡去了？”史密斯又開口問道。
“失去了蹤跡。”第一名特工答道。
“似乎脫離了矩陣。”第二名特工補充道。
“等等……”史密斯忽然說道，同時抬手輕輕碰了碰耳機：“……他們回來了，並且變成了那邊的人……”
“那些人果然也是那邊的人？”第一名特工開口道。
“但依舊不過是區區凡人。”第二名特工平靜的說道。
“似乎不一樣，”史密斯嘴角露出一抹微笑：“我們去會會他們，最好抓活的……還有，盯緊這個叫托馬斯？安德森的傢伙，他的身份恐怕不一般……”
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同樣穿著風衣帶著墨鏡的柴飛跟著亞瑟走在紐約的街頭，再次返回Matrix柴飛的感覺和之前又截然不同。
柴飛問出了一個埋藏在心底的問題：“如果我們現在就找出尼奧並將他救回去，
